Las facciones son fundamentales para el avance en Marathon. Cada facción cuenta con un árbol de mejoras único que ofrece potentes mejoras permanentes a las estadísticas y desbloquea nuevos elementos en la Armería.
Aunque los jugadores puedan inclinarse por una facción específica a medida que avanzan, hay ciertas mejoras generales en cada árbol que son cruciales para optimizar la experiencia inicial del juego. Esta guía detalla cómo desbloquear las mejoras de facción y cuáles son las mejores para priorizar al principio de Marathon.